Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNP1Q6NT89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms