Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC70Q6NSX1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms