Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF6Q6KF10 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF6Q6KF10 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms