Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARA3Q6AZY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARA3Q6AZY7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms