Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD40Q6AI12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms