Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms