Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GARNL3Q5VVW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GARNL3Q5VVW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms