Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRIP1Q5VSL9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms