Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF5Q5TYX0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRAMEF5Q5TYX0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms