Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RSPH4AQ5TD94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RSPH4AQ5TD94 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms