Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms