Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms