Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PERM1Q5SV97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms