Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP188Q5SRE5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms