Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAMD4BQ5PRF9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms