Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCID2Q5JVF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms