Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOM1Q5C9Z4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOM1Q5C9Z4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms