Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HSP90AB4PQ58FF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB4PQ58FF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms