Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FNDC1Q4ZHG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms