Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GREB1Q4ZG55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms