Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPC1LQ4VXU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1LQ4VXU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC1LQ4VXU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1LQ4VXU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms