Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GNPTABQ3T906 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms