Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM30BQ3MIR4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM30BQ3MIR4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms