Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms