Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VWC2Q2TAL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms