Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms