Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRED3Q2MJR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms