Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1AQ16623 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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