Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCAQ16586 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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