Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCBQ16585 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCBQ16585 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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