Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMA4Q16363 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMA4Q16363 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms