Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
VPS72Q15906 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
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