Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6AP1Q15904 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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