Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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