Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPTX1Q15818 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPTX1Q15818 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NPTX1Q15818 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPTX1Q15818 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTX1Q15818 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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