Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGN3Q15651 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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