Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRAM1Q15629 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAM1Q15629 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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