Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2LQ15477 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms