Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBQ15464 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBQ15464 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHBQ15464 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBQ15464 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBQ15464 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBQ15464 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBQ15464 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBQ15464 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBQ15464 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBQ15464 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHBQ15464 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHBQ15464 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHBQ15464 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHBQ15464 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms