Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC41Q15345 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms