Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD3Q15059 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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