Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HDM1Q15032 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
R3HDM1Q15032 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms