Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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