Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPNMBQ14956 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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