Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms