Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF235Q14590 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF235Q14590 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms