Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC3Q14003 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC3Q14003 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms