Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CUL4BQ13620 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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