Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf61Q13536 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf61Q13536 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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