Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD4Q13485 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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